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字符串查找 之 BM算法

最后编辑于: 2021-11-08 15:22  |  分类: 算法&技术思想  |  标签: 字符串   |  浏览数: 1283  |  评论数: 0


Original address:http://blog.csdn.net/sealyao/article/details/4568167#

1、概述

在用于查找子字符串的算法当中,BM(Boyer-Moore) 算法是目前相当有效又容易理解的一种,一般情况下,比KMP算法快3-5倍

BM算法在移动模式串的时候是从左到右,而进行比较的时候是从右到左的。

常规的匹配算法移动模式串的时候是从左到右,而进行比较的时候也是是从左到右的,基本框架是:

j = 0;  

while(j <= strlen(主串)- strlen(模式串)){  
    for (i = 0;i < strlen(模式串) && 模式串[i] == 主串[i + j]; ++i);
    if (i == strlen(模式串))  
        Match;  
    else   
        ++j;  
}  

而BM算法在移动模式串的时候是从左到右,而进行比较的时候是从右到左的,基本框架是:

j = 0;   
while (j <= strlen(主串) - strlen(模式串)) {   
    for (i = strlen(模式串) - 1; i >= 0 && 模式串[i] ==主串[i + j]; --i)   
        if (i < 0)  
            match;  
        else   
            ++j;  
}  

显然BM算法并不是上面那个样子,BM算法的精华就在于++j

2、BM算法思想

BM算法实际上包含两个并行的算法,坏字符算法和好后缀算法。这两种算法的目的就是让模式串每次向右移动尽可能大的距离(j+=x,x尽可能的大)。

几个定义:

例主串和模式串如下:

主串: mahtavaatalomaisema omalomailuun

模式串: maisemaomaloma

好后缀:模式串中的aloma为“好后缀”。

坏字符:主串中的“t”为坏字符。

好后缀算法

如果程序匹配了一个好后缀, 并且在模式中还有另外一个相同的后缀, 那把下一个后缀移动到当前后缀位置。

好后缀算法有两种情况:

Case1:模式串中有子串和好后缀安全匹配,则将最靠右的那个子串移动到好后缀的位置。继续进行匹配。

Case2:如果不存在和好后缀完全匹配的子串,则在好后缀中找到具有如下特征的最长子串,使得P[m-s…m]=P[0…s]。说不清楚的看图。

坏字符算法

当出现一个坏字符时, BM算法向右移动模式串, 让模式串中最靠右的对应字符与坏字符相对,然后继续匹配。

坏字符算法也有两种情况。

Case1:模式串中有对应的坏字符时,见图。

Case2:模式串中不存在坏字符。见图。

移动规则

BM算法的移动规则是:

将概述中的++j,换成j+=MAX(shift(好后缀),shift(坏字符)),即

BM算法是每次向右移动模式串的距离是,按照好后缀算法和坏字符算法计算得到的最大值。

shift(好后缀)和shift(坏字符)通过模式串的预处理数组的简单计算得到。

好后缀算法的预处理数组是bmGs[],坏字符算法的预处理数组是BmBc[]。

3、代码分析

定义

BM算法子串比较失配时,按坏字符算法计算模式串需要向右移动的距离,要借助BmBc数组。

注意BmBc数组的下标是字符,而不是数字。

BmBc数组的定义,分两种情况。

  1. 字符在模式串中有出现。如下图,BmBc[‘k’]表示字符k在模式串中最后一次出现的位置,距离模式串串尾的长度。
  1. 字符在模式串中没有出现:,如模式串中没有字符p,则BmBc[‘p’] = strlen(模式串)。

BM算法子串比较失配时,按好后缀算法计算模式串需要向右移动的距离,要借助BmGs数组。

BmGs数组的下标是数字,表示字符在模式串中位置。

BmGs数组的定义,分三种情况。

  1. 对应好后缀算法case1:如下图:i是好后缀之前的那个位置。

  1. 对应好后缀算法case2:如下图所示:

  1. 当都不匹配时,BmGs[i] = strlen(模式串)

在计算BmGc数组时,为提高效率,先计算辅助数组Suff。

Suff数组的定义:suff[i] = 以i为边界, 与模式串后缀匹配的最大长度,即P[i-s…i]=P[m-s…m]如下图:

举例如下:

分析

用Suff[]计算BmGs的方法。

  1. BmGs[0…m-1] = m;(第三种情况)
  1. 计算第二种情况下的BmGs[]值:

for(i=0;i

if(-1==i || Suff[i] == i+1)

for(;j < m-1-i;++j)

if(suff[j] == m)

BmGs[j] = m-1-i;

  1. 计算第三种情况下BmGs[]值,可以覆盖前两种情况下的BmGs[]值:

for(i=0;i

BmGs[m-1-suff[i]] = m-1-i;

如下图所示:

Suff[]数组的计算方法。

常规的方法:如下,很裸很暴力。

Suff[m-1]=m;

for(i=m-2;i>=0;--i){

q=i;

while(q>=0&&P[q]==P[m-1-i+q])

--q;

Suff[i]=i-q;

}

有聪明人想出一种方法,对常规方法进行改进。基本的扫描都是从右向左。改进的地方就是利用了已经计算得到的suff[]值,计算现在正在计算的suff[]值。

如下图所示:

i是当前正准备计算的suff[]值得那个位置。

f是上一个成功进行匹配的起始位置(不是每个位置都能进行成功匹配的,实际上能够进行成功匹配的位置并不多)。

q是上一次进行成功匹配的失配位置。

如果i在q和f之间,那么一定有P[i]=P[m-1-f+i];并且如果suff[m-1-f+i]=i-q, suff[i]和suff[m-1-f+i]就没有直接关系了。

代码

void preBmBc(char *x, int m, int bmBc[]) {  
   int i;  
   for (i = 0; i < ASIZE; ++i)  
      bmBc[i] = m;  
   for (i = 0; i < m - 1; ++i)  
       bmBc[x[i]] = m - i - 1;  
}  
void suffixes(char *x, int m, int *suff) {  
   int f, g, i;  
  f = 0;  
   suff[m - 1] = m;  
   g = m - 1;  
   for (i = m - 2; i >= 0; --i) {  
      if (i > g && suff[i + m - 1 - f] < i - g)  
         suff[i] = suff[i + m - 1 - f];  
      else {  
         if (i < g)  
            g = i;  
         f = i;  
         while (g >= 0 && x[g] == x[g + m - 1 - f])  
            --g;  
         suff[i] = f - g;  
      }  
   }  
}  

void preBmGs(char *x, int m, int bmGs[]) {  
   int i, j, suff[XSIZE];  
   suffixes(x, m, suff);  
   for (i = 0; i < m; ++i)  
      bmGs[i] = m;  
   j = 0;  
   for (i = m - 1; i >= 0; --i)  
      if (suff[i] == i + 1)  
         for (; j < m - 1 - i; ++j)  
            if (bmGs[j] == m)  
               bmGs[j] = m - 1 - i;  
   for (i = 0; i <= m - 2; ++i)  
      bmGs[m - 1 - suff[i]] = m - 1 - i;  
}  

void BM(char *x, int m, char *y, int n) {  
  int i, j, bmGs[XSIZE], bmBc[ASIZE];  
  /* Preprocessing */  
  preBmGs(x, m, bmGs);  
  preBmBc(x, m, bmBc);  
  /* Searching */  
  j = 0;  
  while (j <= n - m) {  
     for (i = m - 1; i >= 0 && x[i] == y[i + j]; --i);  
     if (i < 0) {  
        OUTPUT(j);  
         j += bmGs[0];  
      }  
      else  
         j += MAX(bmGs[i], bmBc[y[i + j]] - m + 1 + i);  
   }  
}  

再附上一个BM算法的E文wiki条目里的code:

http://en.wikipedia.org/wiki/Boyer%E2%80%93Moore_string_search_algorithm

#include <stdint.h>
#include <stdlib.h>

#define ALPHABET_LEN 255
#define NOT_FOUND patlen
#define max(a, b) ((a < b) ? b : a)

// delta1 table: delta1[c] contains the distance between the last
// character of pat and the rightmost occurence of c in pat.
// If c does not occur in pat, then delta1[c] = patlen.
// If c is at string[i] and c != pat[patlen-1], we can
// safely shift i over by delta1[c], which is the minimum distance
// needed to shift pat forward to get string[i] lined up
// with some character in pat.
// this algorithm runs in alphabet_len+patlen time.
void make_delta1(int *delta1, uint8_t *pat, int32_t patlen) {
    int i;
    for (i=0; i < ALPHABET_LEN; i++) {
        delta1[i] = NOT_FOUND;
    }
    for (i=0; i < patlen-1; i++) {
        delta1[pat[i]] = patlen-1 - i;
    }
}

// true if the suffix of word starting from word[pos] is a prefix 
// of word
int is_prefix(uint8_t *word, int wordlen, int pos) {
    int i;
    int suffixlen = wordlen - pos;
    *// could also use the strncmp() library function here*
    for (i = 0; i < suffixlen; i++) {
        if (word[i] != word[pos+i]) {
            return 0;
        }
    }
    return 1;
}

// length of the longest suffix of word ending on word[pos].
// suffix_length("dddbcabc", 8, 4) = 2
int suffix_length(uint8_t *word, int wordlen, int pos) {
    int i;
    // increment suffix length i to the first mismatch or beginning*
    // of the word*
    for (i = 0; (word[pos-i] == word[wordlen-1-i]) && (i < pos); i++);
    return i;
}

// delta2 table: given a mismatch at pat[pos], we want to align
// with the next possible full match could be based on what we
// know about pat[pos+1] to pat[patlen-1].
//
// In case 1:
// pat[pos+1] to pat[patlen-1] does not occur elsewhere in pat,
// the next plausible match starts at or after the mismatch.
// If, within the substring pat[pos+1 .. patlen0], lies a prefix
// of pat, the next plausible match is here (if there are multiple
// prefixes in the substring, pick the longest). Otherwise, the
// next plausible match starts past the character aligned with*
// pat[patlen-1].
//
// In case 2:
// pat[pos+1] to pat[patlen-1] does occur elsewhere in pat. The
// mismatch tells us that we are not looking at the end of a match.
// We may, however, be looking at the middle of a match.
//
// The first loop, which takes care of case 1, is analogous to
// the KMP table, adapted for a 'backwards' scan order with the
// additional restriction that the substrings it considers as*
// potential prefixes are all suffixes. In the worst case scenario
// pat consists of the same letter repeated, so every suffix is
// a prefix. This loop alone is not sufficient, however:
// Suppose that pat is "ABYXCDEYX", and text is ".....ABYXCDEYX".
// We will match X, Y, and find B != E. There is no prefix of pat
// in the suffix "YX", so the first loop tells us to skip forward
// by 9 characters.
// Although superficially similar to the KMP table, the KMP table
// relies on information about the beginning of the partial match
// that the BM algorithm does not have.
//
// The second loop addresses case 2. Since suffix_length may not be
// unique, we want to take the minimum value, which will tell us
// how far away the closest potential match is.
void make_delta2(int *delta2, uint8_t *pat, int32_t patlen) {
    int p;
    int last_prefix_index = patlen-1;

    // first loop
    for (p=patlen-1; p>=0; p--) {
        if (is_prefix(pat, patlen, p+1)) {
            last_prefix_index = p+1;
        }
        delta2[p] = last_prefix_index + (patlen-1 - p);
    }

    // second loop
    for (p=0; p < patlen-1; p++) {
        int slen = suffix_length(pat, patlen, p);
        if (pat[p - slen] != pat[patlen-1 - slen]) {
            delta2[patlen-1 - slen] = patlen-1 - p + slen;
        }
    }
}

uint8_t* boyer_moore (uint8_t *string, uint32_t stringlen, uint8_t *pat, uint32_t patlen) {
    int i;
    int delta1[ALPHABET_LEN];
    int *delta2 = malloc(patlen * sizeof(int));
    make_delta1(delta1, pat, patlen);
    make_delta2(delta2, pat, patlen);

    i = patlen-1;
    while (i < stringlen) {
        int j = patlen-1;
        while (j >= 0 && (string[i] == pat[j])) {
            --i;
            --j;
        }
        if (j < 0) {
            free(delta2);
            return (string + i+1);
        }

        i += max(delta1[string[i]], delta2[j]);
    }
    free(delta2);
    return NULL;
}

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